《办法》明确提出，在日常绩效评估管理中将充分利用审计成果，对审计发现问题整改不到位的区县（市）、园区市直单位实行扣分；在绩效评估管理结果评定时，各区县（市）、园区、市直单位党政正职出现审计发现问题严重且整改落实不到位的，取消其绩效评估评为“一类”等次的资格。
《办法》的出台有效提升了审计监督效能，通过审计整改绩效评价，以考促整，进一步加强了各单位对审计整改工作的重要性和必要性认识，增强了落实审计整改的自觉性和主动性。有力促进各单位完善政策措施，健全体制机制，充分发挥审计机关“治已病”“防未病”的作用。